Церковь Богоматери датируется 9 веком и была основана Святым Бонифацием, англо-саксонским архиепископом и миссионером, который способствовал утверждению и распространению христианства в Нидерландах.
Первой небольшой церковью на этом месте была часовня в каролингском стиле, датирующаяся приблизительно 875 годом. Строительство нынешней церкви началось в 1230 году. Самая старая её часть, которой является центральный неф храма, построена из дорникского известняка и является типичным примером шельдской готики. Хор и апсиды, возведенные между 1270 и 1280 годами, отражают дух классической французской готики, но выполнены полностью из кирпича. Во время прогулки вокруг церкви вы сможете наглядно увидеть различные этапы строительства храма и три века эволюции готической архитектуры.

На внешних стенах апсид находится ряд надгробий и мемориальных камней известных людей Брюгге. Внутри церкви в центре хора перед главным престолом рядом друг с другом находятся мавзолеи Марии Бургундской в стиле поздней готики и ее отца Карла Смелого, герцога Бургундии и графа Фландрии, в стиле ренессанса.
C правой стороны прохода находится алтарная ниша времен Ренессанса, где вы сможете увидеть всемирно известную работу Микеланджело «Мадонна с Младенцем». Эта скульптура была заказана Папой Римским Пием III (в миру Франческо Пикколомини) для его часовни в соборе в Сиенне. Скульптура была создана 26-летним Микеланджело около 1503 года. Она сделана из каррарского мрамора высотой в 128 см в очаровательном стиле флорентийского ренессанса. Скульптура прибыла в Брюгге в 1514 году, как пожертвование от брюггского купца Яна Мускруна церкви Богоматери.